Для более состоятельных людей в 1818 году на базе Ассигнационного банка был открыт Государственный коммерческий банк. В его правление, чего раньше не бывало, помимо четырёх директоров от правительства входило ещё четыре директора от купечества. Тем не менее правительство набирало штат учреждения, а управляющий назначался лично царём. Коммерческий банк фактически стал первым российским банком современного образца. В нём работало четыре отделения: первое занималось вкладами, второе — векселями, третье — кредитами, четвёртое — хранением депозитов и выдачей денег. Именно тогда сложилась практика, что доступ к ценностям имеют лишь кассиры соответствующего отделения. До этого, как уже говорилось, с ними работали те менеджеры, которые в данный момент непосредственно занимались какой-то операцией.

На этой почве не обходилось без громких хищений. В 1853 году на всю Россию прогремело дело Александровского комитета о раненых. Эта государственная структура оказывала помощь военным-инвалидам, для чего на льготных условиях осуществляла банковские операции с пожертвованиями. Безнадзорность ведомства создавала питательную среду для злоупотреблений. Назначенная в начале 1853 года ревизия выявила громадные нецелевые расходования капиталов: по данным следствия, директор комитета Александр Политковский присвоил свыше миллиона (несколько миллиардов современных) рублей. Поскольку Политковский, опасаясь заключения, покончил с собой, отвечать пришлось председателю комитета, генералу Павлу Ушакову, который был лишён всех чинов и званий и приговорён к длительному тюремному заключению.

Александр Рибопьер — первый управляющий Коммерческого банка

Чтобы привлекать состоятельных вкладчиков, Коммерческий банк предлагал редкую по тем временам услугу — безналичные денежные переводы наподобие итальянских и немецких банков. Производились они следующим образом. Вкладчику нужно было прийти в отделение банка и заявить необходимую для перевода сумму. Банковская комиссия за транзакцию составляла 0,25 % от заявленной суммы (операции в рамках одного и того же отделения были бесплатными). В отделении заявителю выдавалась так называемая трансфертная записка, по которой можно было получить наличные в той конторе банка, где это требовалось. Фактически записка была равноценна векселю и, соответственно, могла быть передана другому лицу. Обработка операции на месте производилась обычно в течение пяти рабочих дней, поэтому выдачи денег приходилось ждать. Поскольку Коммерческий банк был ориентирован прежде всего на купцов, его отделения работали в основном в главных торговых точках страны, в частности, в портах (Архангельске, Одессе, Риге) и ярмарочных пунктах (Нижний Новгород, Ирбит).

Тонкий момент, однако, заключался в том, что Коммерческий банк был государственным, и правительство постоянно пользовалось его средствами в виде беспроцентных кредитов. Это происходило из-за того, что старый Заёмный банк практически не функционировал, поскольку дворянские имения были перезаложены уже по нескольку раз. В условиях расстроенной Крымской войной экономики власти уже не могли выплачивать клиентам оговорённые проценты по вкладам — деньги было просто неоткуда взять. Правительство долго думало, включать ли снова печатный станок, однако, вспоминая о негативном опыте с перекупкой ассигнаций, решило этого не делать. Поскольку проблема оставалась, в 1857 году процент в Коммерческом банке в одностороннем порядке был снижен с 4 до 3 %. Это ожидаемо вызвало возмущение вкладчиков и отток средств из банка в страховые общества и Главное общество железных дорог, владельцы которых предлагали за счёт покупки акций быстро получить хорошие дивиденды. Кассы государственных банков стремительно пустели: за два года с 1857 по 1859 сумма наличности в них упала в десять раз — со 140 до 14 миллионов рублей (с 500 до 50 миллиардов современных соответственно). Чтобы не дать всей системе обвалиться, правительству пришлось прибегать к внешнему займу в 30 миллионов рублей (порядка 100 миллиардов современных).