Среди племен, населявших пустынные острова Огненной Земли, помимо ямана, чоно и алакалуфов были и селькнамы. Идет ли речь о тех самых индейцах, костры которых Магеллан заметил в 1520 году, когда его корабли зашли в пролив, названный позже его именем? Эти индейцы, занимавшиеся охотой и собирательством и обитавшие к северо-востоку от Огненной Земли, выживали в суровых условиях, питаясь моллюсками, ракообразными, птицами и гуанако. На протяжении трех столетий корабли, плывшие под испанскими, голландскими и английскими флагами прежде всего в поисках сказочного города Цезарей, бросали якорь или терпели крушение в этих районах. Экипажи этих кораблей устанавливали контакты с алакалуфами, чоно и ямана. Хотя чужестранцы и коренные жители поддерживали в целом мирные отношения, иногда они приводили к кровопролитию. К концу XVIII века ямана и чоно вымерли. Поскольку селькнамы отличались более крепким телосложением и большей численностью по сравнению с их соседями, а также благодаря своим постоянным переселениям на не занятые территории, они долгое время оставались защищенными от нападений.
В 1880-х годах разделение Огненной Земли между чилийскими властями, землевладельцами и крупными скотоводами отчасти способствовало трагическому исчезновению селькнамов. Чтобы присвоить себе их земли, правительство Чили согнало теуэльче, которых осталось не более сотни, в скромную резервацию. В то время как территории, занятые ямана, еще не входили в число земель, которые колонизаторы планировали эксплуатировать, а те, куда переселялись алакалуфы, не интересовали их из-за своей опустошенности, земли селькнамов, представлявшие собой хорошие пастбища для разведения овец, вызывали у всех жажду наживы. Сколько человек насчитывало население селькнамов в то время? Несколько тысяч? Полторы тысячи, как считает шведский исследователь Отто Норденшёльд? Не более нескольких сотен? Постоянные перемещения этих кочевников, стремившихся сохранить свой образ жизни и избежать контактов с колонизаторами, исключали возможность любого точного подсчета. Несмотря на постоянные и изнурительные скитания селькнамов, чужестранцы и первые эксплуататоры в лице колонизаторов, действовавших стремительно, или нищих искателей приключений, привлеченных богатствами этих новых заселенных земель, не проявляли к островитянам жалости. Они уничтожали тех, кто работал на пастбищах, предназначенных для овец, чья шерсть и мясо, безусловно, представляли бо́льшую ценность по сравнению с теми, кого они считали жалкими и убогими оборванцами. Последовали многочисленные конфликты. Столкнувшись с убийствами, нападениями и грабежами, селькнамы пытались сопротивляться и давать отпор, используя свои скромные возможности. Поскольку они всегда представляли собой какую-никакую опасность, колонизаторы быстро расправились с мятежниками.
Участившиеся столкновения между селькнамами и колонизаторами вынудили власти принять меры. Поразмыслив, как можно установить границы и посты, они остановились на менее затратном решении вопроса, прикрыв его под видом благих намерений: колонизаторы выслали селькнамов в миссию, чтобы приобщить их к культуре и вере. Предполагалось, что эта миссия будет располагаться на одном из самых неприспособленных к жизни островов Огненной Земли – Досоне. Правительство Чили предоставило эту возможность салезианцам. В 1890 году миссия обзавелась школой, современной лесопилкой и столярными мастерскими; сначала в миссию отправляли алакалуфов, затем и селькнамов, большинство из которых попали там в плен.
В 1896 году голод и невероятно суровая зима вынудили десятки измученных селькнамов приехать в миссию. Несмотря на добрую волю и попытку отцов выдать желаемое за действительное, деятельность салезианцев только ухудшила ситуацию и обернулась человеческими трагедиями. Неужели они действительно хотели приобщить к культуре дикарей, которых считали зверями, за счет того, что ссылали их и заставляли работать по дереву? Неудавшаяся попытка обучить их грамоте в сочетании с отдаленным расположением миссии лишили народ селькнамов возможности найти свое место в чилийском обществе. Кроме того, в самом начале века среди детей по непонятной причине наблюдался настолько высокий уровень смертности, что селькнамы полностью вымерли за два десятилетия, на что никто даже не обратил внимания. Когда миссия, превратившаяся в гигантское кладбище, закрылась в 1911 году, в ней покоилось более восьмисот индейцев.
В 1953 году Жозе Амперэр писал: «Мы никогда не узнаем точное число убитых селькнамов. Причины и лица, которые по-прежнему имеют отношение к этому делу, на протяжении полувека продолжают возводить стену молчания вокруг этого дела, которому уже более полувека, охраняя память о них. Сколько бы ни было убитых селькнамов, хоть сто, хоть тысяча, их гибель остается неизгладимым и чудовищным событием в истории начальной колонизации Огненной Земли». До сих пор неизвестно, сколько селькнамов пали жертвами этого этноцида.