После капитуляции и затем роспуска черногорской армии, эмиграции короля и правительства страна оказалась в австро-венгерской оккупации. Еще 13 января была захвачена столица – Цетине, а к 22–23 января уже были заняты Подгорица, Бар и Улцинь, Даниловград и Никшич, к 25 января – Колашин и Андриевица.

На территории страны было образовано австрийское Военное генерал-губернаторство со штаб-квартирой в Цетине. Оккупационная администрация включала сотни чиновников и несколько тысяч жандармов, обеспечивающих контроль над страной. На территории Черногории дислоцировались 22 батальона австро-венгерской армии.

Власти стремились наладить порядок и повседневную жизнь: организовали суды, службы здравоохранения, строительство дорог, работу общественных столовых и домов престарелых. В сентябре 1916 года возобновилась деятельность начальных школ и детских садов. Однако программа обучения подверглась строгой цензуре: из нее исключили историю и литературу, чтобы не пробуждать национальные чувства, а латиница была введена в качестве единственного допустимого алфавита вместо кириллицы.

Вместе с тем оккупационный режим сопровождался тяжелыми мерами. Был введен полный запрет политических партий и общественных организаций. Для устрашения населения власти прибегали к интернированию: уже в 1916 году около 4 тысяч черногорцев были отправлены в лагеря, главным образом в Венгрии. К концу войны общее число интернированных превысило десять тысяч. Условия содержания были крайне тяжелыми, что приводило к высокой смертности. Кроме того, вводились новые налоги, проводились реквизиции сельскохозяйственных продуктов и скота, ресурсы страны расхищались и вывозились в Австро-Венгрию и Германию. Голод был постоянным спутником населения Черногории.

Положение Черногории во многом напоминало судьбу соседней Сербии, где также царили голод, репрессии и массовые интернирования. Народное сопротивление не прекращалось: в 1917 году вспыхнуло Топличское восстание, а в Черногории партизанская борьба продолжалась все время оккупации.

Австрийские солдаты расстреливают сербских повстанцев. 1917

Уже в середине 1916 года в горах начали формироваться партизанские отряды, известные как комиты. Они совершали нападения на патрули, захватывали оружие, карали оккупантов за насилие над местными жителями. К концу того же года действовало около 300 таких групп, а в последующие годы их число выросло почти до тысячи. Австро-венгерские власти отвечали жестокими мерами: любой, кто примыкал к комитам или помогал им, был осужден на смертную казнь.