Меры, принятые патриархом Иеремией в его попытке реорганизовать администрацию западнорусской церкви, оказались неэффективными. Особо возмущало епископов то, что патриарх поддерживал братства.
В 1591 году четыре западнорусских епископа, включая экзарха Кирилла Терлецкого и епископа Львова Гедеона Балабана, направили конфиденциальное письмо королю Сигизмунду III, сообщая ему, что они готовы принять унию с Римом на том условии, что славянский ритуал западнорусской церкви не будет изменен. Таким образом, выяснилось, что патриарх напрасно доверился Кириллу. После этого король начал выдвигать на первые роли тех православных, которые поддерживали идею унии. В 1593 году он назначил епископом Владимира-Волынского русского вельможу Адама Поцея, до этого бывшего кастеляном Бреста. Поцей принял монашеский постриг и получил новое имя Ипатий.
Поцей родился в 1541 году в православной семье и получил хорошее образование в кальвинистской школе, а затем в Краковском университете. В юности он был обращен в кальвинизм, затем, в 1574 году, возвратился в православную веру, а к 1590 году стал склоняться к унии с Римом. Будучи значительно более образованным, нежели другие западнорусские иерархи, Поцей стал лидером униатов. Он, по всей видимости, был единственным западнорусским иерархом того периода, который присоединился к униатскому движению не только по личным соображениям, но и потому, что верил в его религиозную ценность.
Князь Константин Острожский, который знал Поцея задолго до его назначения епископом, 21 июня 1593 года написал ему длинное послание, где выразил желание принять унию с Римом в принципе, но заявил, что она должна быть заключена не одной западнорусской епархией, а всей грекоправославной церковью, а для достижения этого необходимо, чтобы ее поддержали восточные патриархи, московиты и молдаване. Это было неприемлемо для Поцея и тех западнорусских епископов, которые уже известили короля Сигизмунда III об одобрении унии. В декабре 1594 года Поцей и Кирилл Терлецкий составили и подписали соответствующую декларацию, а затем, после долгих отсрочек, получили подписи митрополита Михаила и епископов Полоцка, Пинска и Холма. 1 июня митрополит Михаил, Ипатий Поцей и Кирилл подписали проект «Статей унии», который они отправили королю и папе.
В проекте говорилось об автономном статусе западнорусской церкви под верховной властью папы и неприкосновенности традиционного славянского ритуала. Его авторы настаивали на том, что церковные владения должны остаться нетронутыми, а униатским митрополиту и епископам были предоставлены места в сенате.
Как только князь Острожский узнал о действиях епископов-униатов, он обратился к православным Польши и Литвы с призывом сопротивляться церковной унии, и этот призыв нашел отклик у мирян и большей части духовенства. Дошло до того, что 1 июля епископ Львова Гедеон заявил, что он никогда официально не соглашался на унию и что Кирилл Терлецкий дважды (в 1591 и 1594 годах) злоупотребил бумагами с его подписями, которые он давал Кириллу с другой целью — просить короля воспрепятствовать нападкам католиков на православных. Трудно сказать, можно ли ему верить, поскольку есть достаточно свидетельств, показывающих, что он склонялся к унии в 1591–1594 годах. Но как бы там ни было раньше, теперь Гедеон решительно порвал с униатским движением.
13 июля протест против унии выразили православные Вильно. Главный наставник школы виленского братства Стефан Зизаний написал на русском языке памфлет против унии под названием «Защита православия от папизма», за который митрополит Михаил отлучил его от церкви. Но Зизаний заявил, что, поскольку Михаил оставил православную церковь, у него больше нет власти над православными. Зизаний тут же был арестован и заключен в тюрьму, но ему удалось бежать.
Не принимая во внимание недовольство со стороны православных, король Сигизмунд III провозгласил 24 сентября 1595 года унию западнорусской церкви с Римом. 23 декабря папа Климент VIII дал аудиенцию епископам Кириллу Терлецкому и Ипатию Поцею и благословил их. Проект «Статей», представленный папе, был в Риме пересмотрен, дабы привести западнорусскую униатскую церковь в большее соответствие с римско-католической.
В мае или июне 1596 года король выпустил указ, которым уполномочил митрополита Михаила созвать в Бресте собор западнорусской церкви с целью принятия унии. В августе митрополит объявил западнорусскому духовенству и мирянам, что собор соберется в Бресте в октябре.