Решение вызвало смешанную реакцию в исламском мире, включающую как положительные, так и отрицательные отклики от разных государств и религиозных кругов. Большинство населения этих стран встретило решение с воодушевлением, назвав его «историческим шагом», «вторым завоеванием Стамбула», а президента Эрдогана – «вторым Фатихом». Как отметил министр иностранных дел Чавушоглу, некоторые исламские страны, включая Малайзию, Катар, Иран, Пакистан, Оман, Палестину и Турецкую Республику Северного Кипра, а также отдельные мусульманские сообщества, направили послания с выражением поддержки.
Несмотря на негативную позицию Саудовской Аравии, Объединенных Арабских Эмиратов и Египта, муфтий Омана Ахмед бин Хамед аль-Халили в официальном заявлении поздравил президента Реджепа Тайипа Эрдогана и турецкий народ с решением относительно Айя-Софии.
Генеральный секретарь Всемирного союза мусульманских ученых, базирующегося в Катаре, Али Мухьяддин аль-Карадаги, заявил от имени организации следующее: «Открытие Айя-Софии для богослужений как мечети – это возвращение к ее изначальному назначению и цели вакфа, поскольку султан Мехмед Завоеватель приобрел ее на собственные средства и передал обществу как религиозное учреждение».
Муфтий Иерусалима и Палестины шейх Мухаммед Хусейн также поздравил с открытием Айя-Софии в качестве мечети, выступив с заявлением из мечети Аль-Акса: «Этот храм, в котором до 1934 года совершались молитвы, был ошибочно превращен в музей. Поскольку это вакф, оставленный султаном Мехмедом Фатихом, сегодня его повторное открытие как мечети является правильным решением».