Часовня возвышается над подземной кельей, вырытой Никитой Столпником. В ней он проводил дни и ночи, вымаливая прощение у Бога. Здесь же принял мученическую смерть. Это не просто келья. Это глубокий столп-колодец. Из-за него Никита и получил в народе прозвище Столпник. Глубоко молился – в его случае это не только метафизическое понятие. А молиться было за что и за кого. И своих грехов хватало, будущий святой в прошлом был жестоким сборщиком податей, и приходящие в обитель непременно просили Никиту попросить за них у Всевышнего. А уж когда выяснилось, что у монаха открылся дар исцеления, очереди страждущих стали растягиваться на вёрсты.

Однако эта известность стала для Никиты роковой. Дело в том, что молва разносила также по городам и весям, будто монах носил на себе вериги, цепи, не простые, а серебряные. Слухи, как обычно, были преувеличены, однако дальние родственники инока приняли услышанное за чистую монету и решили поживиться сокровищем. Ночью прокрались они на территорию монастыря, разобрали крышу подземной кельи и зверски убили преподобного. Добычу свою они завернули в холстину и бросились бежать. Наутро пономарь обители увидел разобранную крышу колодца и сообщил об этом игумену. Так обнаружили бездыханное тело Никиты, которое источало благоухание. Святого похоронили в церкви святого великомученика Никиты с правой стороны алтаря.

А преступники тем временем всё бежали. По преданию, добежали до самой Волги. Решив наконец поделить «богатство», они развернули холстину. И увидели при свете дня обычное железо. В ярости воры бросили вериги в речные волны.

В ту же ночь старец одного из монастырей Ярославля Симеон заметил над Волгой три ярких луча, о чём тут же рассказал настоятелю. Иноки и горожане выдвинулись к реке. И увидели вериги, «яко древо в водах волжских плавающие». Цепи были перенесены в Переславскую обитель и положены у гроба Никиты. По преданиям, в этот момент произошло много чудесных исцелений.

Исцеления происходили и потом. Богомольцы верили в силу святого Никиты, веками они приезжали в монастырь приложиться к чудотворным оковам, испить воды из открытого преподобным святого источника и, конечно, посетить место его молитвенного подвига.

В начале XVIII века над подземной кельей Столпника возвели часовню. Находится она между Никитским собором и Благовещенской церковью. Настенные росписи в интерьере церкви иллюстрируют житие преподобного.