После занятия французскими войсками Мадрида, в конце мая 1808 года, французский дивизионный генерал граф Пьер Дюпон (1765–1840) с двумя дивизиями (7–8 тыс. человек) был послан из Мадрида в Андалусию для занятия Севильи и Кадиса. Но начавшееся восстание испанцев против французского господства к югу от Сьерры-Морены вынудило Дюпона не удаляться от Мадрида. Его корпус был слишком слаб, чтобы справиться с повстанцами. Дюпон отступил за реку Гвадалквивир, он был вскоре усилен присланными к нему на подкрепление дивизиями дивизионных генералов графа Доминика Веделя (1771–1848) и Жака Николя Гобера (1760–1808), так что под командованием Дюпона оказалось 21 130 пехотинцев, 3300 кавалеристов и 24 орудия. С юга к Гвадалквивиру подошел испанский генерал-капитан граф Франсиско Хавьер Кастаньос (1758–1852) с Андалузской армией, насчитывавшей 27 110 пехотинцев, 2600 кавалеристов и 25 орудий. Дюпон занял оборону с тремя дивизиями на укрепленной переправе в Андухаре, а дивизию Гобера оставил в деревне Байлен на Гвадалквивире для охраны пути отступления к Мадриду. Позиция корпуса Дюпона была неудачной. Гвадалквивир летом пересох и серьезным препятствием не являлся, а в тылу находился широкий горный проход Сьерра-Морены. 16 июля Кастаньос с двумя дивизиями произвел демонстрацию против центра и правого фланга Дюпона, а две другие более сильные дивизии генерал-лейтенантов швейцарца Теодора фон Рединга (1755–1809) и француза маркиза Антуана де Мале де Купиньи (1761–1825) (20 тыс. человек) направил в обход левого фланга французов в Мендхибар. Рединг и Купиньи разбили дивизию Гобера, который был смертельно ранен. Ведель, посланный Дюпоном опрокинуть неприятеля за Гвадалквивир, получил в Байлене ложное сообщение, будто испанцы направились к Санта-Каролине в 6 милях за Байленом, вблизи горных проходов, и попытался их прикрыть, заняв Санта-Каролину. Бригадного генерала Франсуа Бертрана Дюфура (1765–1832), заменившего Гобера, он послал еще дальше, в Санта-Элену. Отряд Дюпона оказался разделен на две части, удаленные друг от друга на расстоянии двух дневных переходов.

Между тем Рединг и Купиньи заняли позиции у Байлена между Дюпоном и Веделем. Дюпон, до последнего ожидавший главный удар испанцев в Андухаре, наконец оценил опасность своего положения и в ночь на 19 июля двинулся к Байлену, где его ждала ловушка. Утром 19 июля Дюпон встретил дивизию Рединга, занявшую позиции у ручья Румблара, на плоской возвышенности. Узкая обрывистая дорога позволяла атаковать только небольшими силами при поддержке не более чем 1 орудия. Дюпон бросил в бой кавалерию и отбросил испанских кавалеристов, но прорвать линию пехоты так и не смог, хотя атаковал семь раз. Два полка швейцарской пехоты из корпуса Дюпона, ранее служившие в испанской армии, внезапно перешли на сторону испанцев. Эта измена деморализовала французские войска. Дюпон еще надеялся, что Ведель, услышав артиллерийскую стрельбу, придет к нему на помощь, но днем в его тылу появилась испанская дивизия генерал-лейтенанта Мануэля де-ла-Пенья (1766–1827), которую Кастаньос послал из Андухара. Окруженный превосходящими силами испанцев и имея боеспособными только 2 тыс. солдат, Дюпон заключил перемирие и начал переговоры о капитуляции. Французы к тому времени почти исчерпали боеприпасы и в условиях летней жары страдали от нехватки воды.

Капитуляция при Байлене.

Художник Х. Касадо дель Алисал. 1864 г.

Ведель, услышав стрельбу в направлении Байлена, двинулся туда, но только к 17 часам, когда войска Дюпона были уже окружены, подошел к Байлену. Он атаковал дивизию Купиньи и взял в плен ирландский батальон в 1500 человек и 2 орудия, но его дальнейшее наступление было остановлено упорным сопротивлением испанцев. После объявления о перемирии Ведель прекратил боевые действия и сложил оружие, так как Кастаньос пригрозил истребить окруженный и неспособный к сопротивлению отряд Дюпона, если Ведель продолжит атаковать. 23 июля была подписана Байленская или Андухарская капитуляция. Вручая свою шпагу Кастаньосу, Дюпон воскликнул: «Вы можете гордиться этим днём, генерал; это знаменательно, потому что до сих пор я никогда не проигрывал в генеральном сражении — я, который участвовал в более чем двадцати таких сражениях». Испанец ответил с усмешкой: «Это тем более знаменательно, что я никогда в жизни не участвовал ни в одном генеральном сражении». Согласно условиям капитуляции, войска Дюпона (8 тыс. человек) должны были быть отправлены в Кадис. Войска же Веделя и Дюфура (9 тыс. человек) должны были быть разоружены и направлены к побережью Средиземного моря и оттуда переправлены на судах во Францию. Но испанцы нарушили условия перемирия, тем более что переправить пленных французов судами во Францию не было никакой возможности — на Средиземном море господствовал британский флот. В результате все французские пленные были отправлены в Кадис, а оттуда на остров Кабреру (7 тыс. человек) и на Канарские и Балеарские острова (10 тыс. человек). В плен попало 17 635 французов, из которых до возвращения во Францию в 1814 году дожили только около 3 тыс. человек, остальные умерли от голода и болезней. До капитуляции французы потеряли 2200 убитыми и 400 ранеными. Около 3 тыс. швейцарцев перешло на сторону испанской армии. Потери испанцев составили 243 убитыми и 735 ранеными. Во Францию морем на кораблях британского флота были отпущены только генералы и штаб-офицеры. Дюпон, а также сыгравший главную роль при переговорах о капитуляции дивизионный генерал-инженер Арман Самюэль де Мареско (1758–1832) за капитуляцию были преданы Наполеоном суду. Дюпон находился в заключении до самого низложения Наполеона, а Мареско провел в тюрьме три года, а потом был отправлен в ссылку в Тур. Дюпон действительно был главным виновником разгрома французов. Он занял неудачную позицию, растянул свои силы и принял демонстративное наступление противника за главный удар.

Следствием разгрома французов при Байлене стал крах планов Наполеона быстро покончить с сопротивлением испанской армии и народа. Назначенный Наполеоном королем Испании его старший брат Жозеф Бонапарт (1768–1844) вынужден был отступить из Мадрида за Эбро. Наполеону пришлось в октябре 1808 года самому предпринять поход в Испанию во главе 250-тысячной армии, чтобы выправить положение. Но, разбив регулярную испанскую армию, Наполеон не смог подавить широкое партизанское движение, поддерживаемое британским экспедиционным корпусом и британским флотом. И французы так и не смогли захватить главный испанский порт Кадис. Поражение французов вдохновило Австрию и Англию на формирование Пятой антифранцузской коалиции.