В 1814 г. император Александр I (указом от 30 августа 1814 г.) поддержал обращение к нему греческой общины Таганрога о передаче их Иерусалимского Александровского монастыря во имя святой Троицы в ведение Иерусалимского Патриархата. Так монастырь этот, построенный в 1809–1814 гг. на средства Ивана Андреевича Вараскиса (1745–1825), российского дворянина греческого происхождения, бравшегося обеспечить монастырь содержанием и угодьями, стал фактически исполнять функции подворья Иерусалимского Патриархата на русской земле и сделался действенным инструментом по поддержанию отношений между Русской Православной Церковью и Иерусалимским Патриархатом. Согласно достигнутым договоренностям, Иерусалимский Патриарх обязался присылать в монастырь греческих архимандрита и братию для совершения богослужений.
Из истории этого мужского монастыря известно, что со 2 по 29 декабря 1825 г. там покоилось тело усопшего Всероссийского императора Александра I Павловича (1801–1825). В 1831 г. перед монастырем ему установили памятник, который снесли в эпоху Советской России и восстановили в 1998 году. В 1923 г. монастырь закрыли, а спустя три года все монастырские сооружения вместе с церковью и вовсе разобрали.
В 1818 г. по воле императора Александра I, решению Святейшего Синода Русской Православной Церкви и с благословения Патриарха Прокопия было открыто в Москве, при церкви святого апостола Филиппа на Арбате, официальное Иерусалимское подворье во главе с архимандритом Арсением, в том числе и для собирания подаяний «в пользу Иерусалимского Храма» (46). Архимандрит Арсений предлагал также учредить Русское подворье в Иерусалиме, где могли бы останавливаться православные паломники-россияне, отправлявшиеся на богомолье к Святым местам в Палестине, и которое служило бы Святейшему Синоду Русской Православной Церкви для поддержания отношений с Иерусалимским Патриархатом. «В Иерусалиме, – писал он в обращении к императору Александру I с просьбой о поддержке русских паломников, прибывающих в Святую Землю, – никто столько не терпит бедностей и нужды в пище и одежде, и в самом убежище, как поклонники русские».
К сведению читателя, подворье Иерусалимского Патриархата в Москве до сих пор действует при храме Воскресения Словущего (апостола Филиппа) на Арбате (Филипповский переулок, 20).
После Иерусалимского подворья, официального представительства в Москве Патриарха Иерусалимского, открылись подворья-представительства и всех других патриархов Православного Востока: Патриарха Антиохийского (1848), Патриарха Александрийского (1856) и Патриарха Константинопольского (1883).