Марию провозгласили королевой Шотландии, когда девочке не было и одного года. В её стране также шла ожесточённая борьба между протестантами и католиками, ориентировавшимися, соответственно, на Англию и Францию.
Мария воспитывалась при французском дворе и в 1559–1560 годах даже была королевой Франции в качестве супруги рано умершего Франциска II. Овдовев, она вернулась на родину и вступила во второй брак со своим родственником Генрихом Стюартом, лордом Дарнли. Но её сердце принадлежало Джеймсу Хепберну, графу Ботвеллу. Кончилось тем, что дом Дарнли был взорван, а его тело нашли в саду, – вероятно, его убили при попытке бежать из горящего здания. Подозрения пали на Ботвелла, что дало повод протестантам свергнуть Марию Стюарт, которая, бежав в Англию, попросила убежища у Елизаветы.
Свергнутая королева жила в Шеффилдском замке, по факту став знаменем английских католиков, которые затевали заговоры в её пользу. Насколько об этих заговорах была осведомлена сама Мария – вопрос открытый. Но доказательства все же сфабриковали с помощью одного из тайных агентов. Марию обвинили в том, что она собиралась свергнуть свою «благодетельницу», и обезглавили 8 февраля 1587 года.
Елизавета была бездетна, и наследником английского престола она признала сына и преемника Марии Стюарт на троне Шотландии Якова VI. В 1603 году он по совместительству стал королём Англии под именем Якова I, но только в 1707 году Англия и Шотландия окончательно сольются в одно государство.