Её первый вылет 4 ноября 1917 годка был важным событием не только для Фридрихсхафена. Это огромное взлетающее с воды сооружение конструктора Дорнье ждали на Северном море, где шла война. Флот прислал к Дорнье для лётных испытаний этой громады своих лучших морских лётчиков Вайсса и Хаммера. Они уже чувствовали себя комфортно в открытой кабине корпуса близко от холодной ноябрьской воды, брызги которой долетали до них при встрече с большой волной. Наверху сзади ревели четыре самых мощных в то время мотора. Они ни разу не подводили на скоростных пробежках по воде Боденского озера, и пилоты надеялись, что не подведут и сейчас на взлёте. И действительно не подвели. Такой суммарной мощностью двигателей не обладала ни одна из предыдущих лодок Дорнье. Третья большая лодка Дорнье спокойно взлетела и, демонстрируя хорошую управляемость, начала набирать высоту. Компактное расположение моторов относительно продольной оси самолёта позволяло при отключении одного из них сбалансировать машину только рулём направления.
Уже через три недели Дорнье сообщает командованию флота, что Rs.III в самое ближайшее время будет готова совершить перелёт на базу Нордерней в Северном море. А ведь он прекрасно понимал, что существует огромное количество причин, которые в любой момент могут прервать полёт такой сложной машины.
На небольшом островке Нордерней недалеко от побережья, где располагалась база гидросамолётов германского флота, специально для новой большой летающей лодки Дорнье был сооружен просторный ангар. Маршрут перегона из Фридрихсхафена тщательно отрабатывался с учётом опыта неудавшегося перегона предыдущей лодки Rs.IIb без малого полгода тому назад. Согласовали истребительное прикрытие в районе радиуса полёта самолётов Антанты и предупредили своих зенитчиков. Дорнье получал ежедневный прогноз погоды по маршруту. А он зимой был нерадостным. Рейн закрыт плотным туманом. Погоду дали только 19 февраля 1918 года.
В состав экипажа включили пилотов Вайсса и Триллера, инженера Шульте-Фролинде и механика Хайнцельманна. Они взлетели в 9:40 утра, прошли Шварцвальд на высоте 2 км. В открытой кабине было очень холодно. Подошел истребитель сопровождения и не уходил, пока не повернули от Рейна на Мюнстер. Упало давление масла в моторе № 2, но его решили не выключать. После Мюнстера пошли по реке Эмс до Эьдена, а там уже недалеко и Нордерней. Мягко приводнились возле базы флота в 16:45. Мотор № 2 работал и топлива ещё ещё оставалось на два часа полёта. В этом семичасовом перелёте новая летающая лодка Дорнье Rs.III продемонстрировала свои высокие качества.
Большая летающая лодка Дорнье Rs.III на Северном море, 1918 год
Теперь её войсковыми испытаниями на волнах и в небе Северного моря занялись моряки. Лодка взлетала, подняв нос корпуса вверх, при высоте волн до четырёх метров. При этом брызги не достигали воздушных винтов. Посадка на волны моря также не создавала проблем. Во время тяжелой продольной качки на воде зазор между оперением и вершиной волн был не менее метра.
За четыре месяца испытаний моряки выявили и недостатки конструкции. Подойти к работающим моторам во время полёта из-за сильного обдува воздушными винтами было практически невозможно. Были случаи отрыва полотняной обшивки в центральной части крыла.
В целом военные моряки высоко оценили творение Дорнье, признали лодку годной для несения дальней разведывательной и патрульной службы на флоте. Для Клода Дорнье и его заводов, участников постройки третьей большой лодки, это была победа. Их трудом создан выдающийся боевой самолёт для флота, способный лететь десять часов. Его металлическая конструкция обладает большим сроком службы, и на фоне деревянных самолётов является новым достижением.
Особенно было приятно читать те доклады моряков, в которых они сравнивают их летающую лодку с установленным на поплавки четырёхмоторным деревянным бомбардировщиком, выпущенным заводом компании Цеппелин в Штаакене. Там было написано, что их лодка-моноплан показала полное превосходство. Она была быстрее и легче в управлении, обладала лучшими летными характеристиками и показала большую надежность, чем машины завода Штаакен. Её мореходные характеристики были выше, чем у поплавкового гидросамолета Штаакен. Эти отзывы говорили о высоком техническом профессионализме создателей Rs.III. У флота Германии другой такой дальней летающей лодки не было.
А в конструкторском бюро Дорнье уже разрабатывали чертежи следующей большой Rs.IV. Флот заказал сразу две такие машины. На стадии выбора облика Клод Дорнье провёл тщательный сравнительный анализ вариантов биплана и даже триплана и пришел к выводу, что моноплан лучше. Он также подтвердил преимущества верхнего узкого и длинного фюзеляжа. Выходило, что схема лодки Rs.III является оптимальной и для Rs.IV.
В судьбе большой Rs.III отразится то неспокойное время, в котором её создали. До конца войны она будет нести боевое дежурство. После войны будет продолжать надёжно служить флоту и участвовать в обезвреживании мин в Северном и Балтийском морях. Германское правительство в то время оценивало стоимость летающей лодки Дорнье Rs.III в один миллион марок. По приказу Контрольной комиссии союзников в конце июля 1921 года она будет разрушена.