Пчелиная матка подвергается многим заболеваниям, затрагивающим в том числе и функцию половой системы. На подобные нарушения могут влиять следующие факторы:

1. Неправильное развитие семяприемника. Он может отсутствовать или быть недоразвитым.

2. Недоразвитость влагалища. Обычно встречается при запоздалом скармливании матки из личинок или прививка личинок старше одних суток в искусственные мисочки при искусственном выводе.

3. Застуживание матки особенно весной в слабых семьях или же при раздаче их в отводки в виде зрелых маточников, которые не в состоянии поддерживать оптимальную температуру в гнезде в пределах 35–36 °C. Такая матка впоследствии может откладывать до 30–50 % трутневых яиц, и естественно, ее необходимо заменить.

4. Откладывание яиц матками, зародыши которых гибнут за несколько часов до вылупления личинок. Причина заболевания, возможно, результат близкородственного разведения.

5. Откладывание яиц маткой, из которых нарождается «пустой» невыводящийся расплод. Он гибнет на стадии куколки в уже запечатанных ячейках. Выглядит он в виде маленьких запечатанных сформированных пчел. Эти болезни (1–5) незаразные.

6. Поражение яичников или других внутренних органов матки (задней кишки, ядоносного пузыря). Это болезнь инфекционного характера, известна под названием «меланоз».

Смешанный пчелиный и трутневый расплод обычно указывает на плохое качество матки, заболевания семяприемника или некачественное ее оплодотворение трутнями во время брачного облета. В любом случае пчеловоду приходится заменять ее на молодую матку. Для этого необходимо иметь на пасеке не менее 10 % плодных маток в нуклеусах или отводках.