Право Черногории на проведение референдума о независимости в конце 2005 года подтвердил Евросоюз, а Венецианская комиссия Совета Европы в конце 2005 года установила правила, согласно которым для принятия решения о независимости требуется поддержка 55 % избирателей.
В марте 2006 года парламент Черногории принял Закон о референдуме о государственном и правовом статусе Республики Черногория.
Кампания развернулась между двумя политическими блоками: сторонниками независимости во главе с Джукановичем и унионистами, которых возглавил Предраг Булатович, лидер Социальной народной партии.
Референдум 21 мая 2006 года прошел под наблюдением ЕС, ОБСЕ и Совета Европы. При явке 86,5 % за независимость проголосовали 55,5 % избирателей – ровно столько, сколько требовалось для признания результата. 3 июня 2006 года парламент Черногории официально провозгласил государственную независимость. Вскоре она была признана всем мировым сообществом и принята во все европейские объединения, а 28 июня 2006 года Черногория стала 192-м членом Организации Объединенных Наций.