К книге
Кошки, гены и эволюцияГлава 10 Коты из Сан-Паулу и геногеография. Вычисление частот аллелей
60%
Глава 10 Коты из Сан-Паулу и геногеография. Вычисление частот аллелей
102

Набрав сотню-другую таких наблюдений, можно переходить к их анализу. Полностью последовать методу Серла мы не можем, потому что он знал пол всех объектов своего анализа, а мы его знать не будем, потому что на глаз пол не определишь.

То есть, конечно, есть несколько случаев, когда пол можно определить на глаз. Если мы видим особь, которая кормит своих котят, то это, очевидно, самка. Соблазнительно думать, что если две особи орут друг на друга дикими голосами или, пуще того, дерутся, то они оба самцы. Но с уверенностью тут сказать ничего нельзя, ибо у некоторых самок нрав на редкость вздорный. Черепаховые особи – это с вероятностью 0,9999 самки.

Как бы там ни было, эти редкие наблюдения погоды не делают. Поэтому нам придется смириться с тем, что пол абсолютного большинства наших объектов нам не известен. Значит, мы не можем использовать соотношение рыжих, черепаховых и нерыжих особей для решения вопроса о том, соответствует ли наша популяция требованиям закона Харди – Вайнберга. Нам придется допустить, что наши коты ничем не хуже лондонских котов и тоже соответствуют.

Приняв это допущение, мы можем оценивать частоты аллелей в нашей популяции, зная численности кошек с различными генотипами и используя уравнение Харди – Вайнберга для соотношения частот (f) генотипов А/А, А/а и а/а.

где р – частота аллеля A; q – частота аллеля а.

Зная частоту гомозигот по рецессивному аллелю, мы можем определить частоту этого аллеля. Для подсчета частоты любого рецессивного аллеля, например l, можно использовать выражение:

В этой и во всех следующих формулах: р – частота соответствующего доминантного аллеля; q – частота рецессивного аллеля, n – число кошек соответствующего генотипа, а N – число особей, у которых генотипы по данному гену однозначно определены. Например, для гена длинной шерсти (l) N – это все учтенные коты, так как длинношерстность видна всегда. Для гена не-агути (a) N – это все учтенные коты, кроме рыжих (O/O), так как у рыжих сложно определить генотип по a.

А вот для аллеля не-агути a в знаменатель формулы нужно внести поправку. Мы вынуждены исключать из выборки рыжих кошек и котов, так как на фоне рыжей окраски сложно установить разницу между не-агути (а/а) и агути (А/_) типом распределения пигмента в волосе.

Для определения частоты аллеля tab мы исключаем из N число черных кошек:

Частоты доминантных мутантных генов удобнее всего считать, вычитая из единицы частоты соответствующих нормальных рецессивных аллелей.

Для гена WS формула будет такой:

Формула для определения частоты аллеля рыжей окраски, предложенная Роем Робинсоном (о нем мы поговорим чуть позже), выглядит так:

Вот теперь у вас есть все формулы. После того как вы оцените частоты аллелей в ваших популяциях, можно переходить к самому интересному: сравнить ваши данные с мировыми и интерпретировать их сходства и различия в контексте эволюции кошачьих и человеческих популяций.

Задача ваша сильно облегчается тем, что вам есть с чем сравнивать. К 2018 году было опубликовано 348 статей (из них 65 на русском) и 16 разных диссертаций (от бакалаврских до кандидатских), содержащих сведения о частотах аллелей окраски в 607 разных точках нашей планеты и попытки анализа этих данных. Сергей Холин, исследователь из Федерального научного центра биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения РАН, проделал гигантскую работу по сбору этих данных165.

Предыдущая главаГлава 102 из 169Следующая глава