Родовитое боярство, сокрушенное еще опричниной, было окончательно добито Смутой. Старинные княжеские роды или вымерли или потеряли влияние.

Боярская дума теряет свои права, если они были, и, во всяком случае, свое значение. В государеву печать вводится титул «самодержца».

На первое место выдвинулось незнатное дворянство. В его пользу при первом из Романовых был издан указ, продолживший срок преследования беглых крестьян с 5 лет до 10 лет. Все более и более сокращалось количество крестьян, которые сохранили право свободного перехода.

К середине XVII века в Москве установилось такое же суровое крепостное право, какое было сто лет назад в странах Европы.

После окончания Смутного времени понадобилось много усилий, чтобы восстановить разоренную страну. Для развития различных промыслов в Россию на льготных условиях были приглашены иностранные промышленники – рудознатцы, оружейники, литейщики. Голландский купец Виниус получил позволение построить в Туле завод для литья пушек и ядер.

Правительством царя Михаила были приняты меры по ограничению власти воевод на местах. Было положено начало военным преобразованиям. Иностранные офицеры обучали русских «ратных людей» военному делу, и в России появились «полки иноземного строя». Это был первый важный шаг к созданию регулярного национального войска в России.

Царь Михаил Федорович сознавал пользу науки, как видно из его желания пригласить на службу Адама Олеария, о котором царю «известно учинилось, что он гораздо научен и извычен астрономии, и географус, и небесного круга, и землемерию, и иным многим надобным мастерствам и мудростям, а нам, великому государю, такой мастер и годен». Михаил Федорович вообще интересовался географией и велел сделать дополнение и объяснение к карте Московского государства, составленной по приказанию Бориса Годунова, известной под названием «Большой чертеж русской земли».

К концу царствования сложилась под Москвой «Немецкая слобода», поселение иностранцев военных и техников. Их трудами поставлено несколько заводов в провинции.

Михаил Федорович скончался 13 июля 1645 года от водяной болезни в возрасте 49 лет.

Он похоронен в Архангельском соборе Кремля.