Кишечная микробиота – это триллионы бактерий, вирусов, грибов и других микроорганизмов, населяющих наш кишечник. Эти микроорганизмы не просто пассажиры, они активные участники метаболизма, иммунной функции и даже поведения. Они выполняют множество функций: переваривают неперевариваемую клетчатку, синтезируют витамины групп B и K, обучают иммунную систему, производят нейромедиаторы, защищают от патогенов.

16S-секвенирование рибосомальной РНК – это метод, который позволяет идентифицировать, какие именно бактерии присутствуют в кишечнике и в каких пропорциях, по уникальной последовательности гена 16S рРНК, который есть у всех бактерий. Это похоже на перепись населения микробного города: сколько жителей каждого вида, какие районы они населяют, как меняется состав со временем.

С возрастом состав микробиома меняется. Крупное исследование показало, что у людей в возрасте 80+ лет здоровое долголетие связано с разнообразием микробиома и уменьшением доминирования рода Bacteroides. Низкая уникальность микробиома (то есть композиция, типичная для среднего человека этого возраста) ассоциировалась с хрупкостью, воспалением и смертностью.

Более того, появились работы по микробиомным часам: по ним можно предсказывать биологический возраст человека, а отклонения от нормальной возрастной траектории отражают ускоренное или замедленное биологическое старение.

Однако важно понимать, что на сегодняшний день анализ микробиома имеет в основном исследовательское значение. Отсутствуют общепринятые клинические референсные интервалы, позволяющие однозначно сказать, что хорошо, а что плохо. Микробиом индивидуален, как отпечатки пальцев, и его интерпретация требует осторожности. Область микробиомных исследований еще молода. Большинство данных пока ассоциативны: мы видим связи, но не всегда понимаем причинно-следственные механизмы. Стандарты интерпретации еще не устоялись, и клиническое применение 16S-секвенирования остается в основном исследовательским инструментом, а не рутинной клинической практикой.

Один из ключевых метаболитов, производимых некоторыми кишечными бактериями, – триметиламин-N-оксид (ТМАО). Он образуется, когда бактерии расщепляют холин и карнитин из мяса, яиц и молочных продуктов, а затем печень превращает промежуточный продукт – триметиламин – в ТМАО. Повышенный уровень ТМАО в крови ассоциирован с повышенным риском атеросклероза, инфаркта, инсульта и смертности. Механизм, вероятно, связан с тем, что ТМАО ускоряет накопление холестерина в макрофагах и образование пенистых клеток – ключевого звена атеросклеротической бляшки.