Введенская церковь возведена в 1710 году на средства сестры Петра I Натальи Алексеевны. При этом царица выпросила у брата разрешение построить храм каменным, тогда как по специальному указу императора строить из камня в то время разрешалось только в Петербурге.

В конце XVII века в Переславле-Залесском на Плещеевом озере появилась «потешная флотилия» Петра I. Здесь царь постигал искусство судостроения. И практический в каждый свой приезд заезжал на молитву в Феодоровскую обитель, стоящую по пути из Москвы к озеру. А в 1692 году настоятельницей монастыря стала подруга детства Петра Алексеевича, дочь дьяка Оружейной палаты Наталия Взимкова. Вероятно, все эти факты и повлияли на решение государя пойти против собственного указа.

Введенская церковь строится с двумя приделами: во имя иконы Божией Матери «Знамение» и в честь святых мучеников Адриана и Наталии, последняя была небесной покровительницей царевны. Храм украшали уникально выполненные резные Царские врата XVIII века, которые сейчас находятся в переславском музее. На средства Натальи Алексеевны также построили Казанскую церковь для престарелых и больных монахинь монастыря. В облике этих сооружений чувствуются европейские веяния – отсюда их простота, чёткость и сдержанность.

Влиянием Европы на архитектуру дело не кончилось. В 1722 году император приехал в Феодоровский монастырь и привёз с собой немецкие ткацкие станки. Он наказал монахиням учиться ткачеству. Спустя время обитель прославилась своими мастерскими. Здесь производили ткань для нужд царского двора, а также изготавливали церковные облачения и утварь. На вырученные деньги сёстры могли заниматься благотворительностью, воспитывать сирот, и теперь сами, без помощи покровителей, ремонтировать и расписывать храмы.

После того как советская власть Феодоровский монастырь закрыла, во Введенской церкви устроили баню и прачечную. От сырости сразу же погибли его росписи. Так окончательно была уничтожена не только память о былом благолепии храма, но и о трудовых подвигах сестёр.

Монастырь в 1998-м вернули Русской Православной Церкви. И в этом же году, на Пасху, во Введенской церкви совершили первую литургию. В последующие годы храм был восстановлен. Сегодня именно в нём хранится главная святыня обители – чудотворная Андрониковская икона Божией Матери.