В отличие от бактерий (полноценных безъядерных клеток), вирусы – это просто кусок ДНК или РНК в оболочке из белков. Им нужно внедриться внутрь других живых клеток, чтобы использовать их ресурсы для копирования своего генетического материала. Известно 8 семейств вирусов, которые могут поражать кишечник. В их числе энтеровирус, ротавирус, аденовирус, коронавирус, астровирус. Инфекции передаются через воду, загрязненные продукты и грязные руки – от человека к человеку, в основном – от ребенка к ребенку.

Самым частым возбудителем среди всех кишечных инфекций является ротавирус. Многие считают это безобидным поносом, но в действительности по данным ВОЗ это заболевание ежегодно уносит жизни более 200 тысяч детей. В отличие от бактериальных инфекций ротавирус распространен даже в странах с высоким уровнем санитарной культуры. Ротавирусной инфекцией болеет большинство детей, но летальность в разных странах существенно отличается. В государствах с хорошей медициной смертность близка к нулевой, в то время как в развивающихся государствах достигает 2,5 %. Дети умирают от обезвоживания, хотя их могли бы спасти, если бы своевременно поставили капельницу или хотя бы напоили должным образом (хотя это не всегда возможно из-за рвоты и очень быстрой потери жидкости через кишечник).

Ещё один способ спасения таких детей – вакцинация. В отличие от многих других прививок, вакцина от ротавируса принимается внутрь, так что даже колоть ничего не нужно. В России вакцина от ротавируса не входит в обязательный календарь прививок. Первую дозу стоит использовать уже с шести недель, ведь нужно успеть сформировать иммунитет до заражения ребенка, которое с высокой вероятностью случится уже в первый год жизни. Повторные дозы используют через 4 недели. Заболеть после прививки все равно можно, но инфекция будет протекать намного легче.

Энтеровирусы являются второй вирусной причиной кишечных инфекций. На них приходится по оценкам разных авторов от 7 до 18 % случаев. Чаще всего болеют дети 2–6 лет. Это легкая инфекция, с ней редко попадают в больницу.

Аденовирус в основном поражает дыхательные пути, но может вызывать воспаление кишечника. Он занимает третье место в структуре вирусных кишечных инфекций человека. Кишечными считают типы аденовируса F и G, но и другие типы могут вызывать воспаление. Аденовирус F впервые обнаружен в 1975 году. Их назвали кишечными (enteric – EAdV). Они поселяются в клетках тонкого кишечника. Эти вирусы устойчивы к действию кислот, желчи и протеаз (ферментов, расщепляющих белки). Исследования в Москве показали, что аденовирусы типа F являются возбудителями у 4 % детей, которых госпитализировали в стационар по поводу кишечной инфекции. Вирусов этого типа два: HAdV41 и HAdV40. При заражении HAdV41 диарея более продолжительная. Аденовирусы типа G описаны только в 2007 году в США. Они не являются широко распространенными.

После перенесенных вирусных инфекций часто остаются проблемы в кишечнике: нарушение микрофлоры, повышенная проницаемость, небольшое воспаление, синдром раздраженного кишечника. Нередко эти проблемы мучают людей месяцами и годами.