Для исследования кишечника иногда используют рентген (ирригоскопия) и компьютерную томографию кишечника (КТ-колография). При ирригоскопии в кишечник вводят барий, а затем делают рентгеновские снимки. Бариевая смесь растекается по слизистой оболочке, обозначая на снимках её рельеф. Сегодня ирригоскопия вышла из моды. Её делают лишь в случаях, когда нет технической возможности сделать колоноскопию или есть подозрения на плохую проходимость кишечника, как бывает при мегаколоне, спайках в брюшной полости или обструкции кишки. Чувствительность у ирригоскопии гораздо ниже. Если полипы размером более 10 мм она выявляет в 100 % случаев, полипы от 6 до 9 мм только в 83 % случаев. Но есть и такие заболевания, при которых ирригоскопия более эффективна, чем колоноскопия. Например, она лучше видит недостаточность илеоцекального клапана и помогает определить, нужна ли человеку операция.

Заменой ирригоскопии стала колоноскопия и КТ кишечника. Особенность и главное её отличие от колоноскопии в том, что врачи видят не только поверхность слизистой оболочки кишечника, но также его стенку на всю толщину, располагающиеся рядом органы и ткани. Можно увидеть увеличенные лимфоузлы, распространение воспаления за пределы кишечника, метастазы рака в печени или других органах. КТ кишечника делают не для того, чтобы поставить диагноз, а чтобы его уточнить при воспалении, язвенном колите или болезни Крона, дивертикулите или раке кишечника. С помощью определенных вариантов КТ кишечника можно оценить кровообращение в сосудах кишечника (ангиография). Это важно при тромбозе, атеросклерозе, воспалении, онкологии. Можно даже сделать трехмерную реконструкцию кишечника. Цветное картирование позволяет отличить воспаление от опухоли.

В последние годы КТ кишечника начали использовать в качестве альтернативы для определения рака. Это исследование проводят 1 раз в 5 лет. «Виртуальная» колоноскопия, в отличие от реальной, не вызывает ни малейшего дискомфорта. Правда, у исследования есть недостаток: если в кишечнике найдут полипы, их нельзя удалить. Также невозможно провести биопсию. Так что, дополнительно придется сделать обычную колоноскопию. Срезы при проведении КТ-колографии делаются через каждые 3 мм. Так что даже у мелких полипов не так много шансов скрыться от врача. Лишь некоторые из них прячутся между срезами, тогда их найдут при следующем обследовании. КТ-колография имеет высокую чувствительность: она составляет 95 % для полипов и 97 % для опухолей толстой кишки.

Важным преимуществом КТ как метода скрининга является возможность обнаружения внекишечных заболеваний как «случайных находок», на которые никто не жалуется. Учитывая возраст, обнаруживаются такие находки довольно часто. Например, по данным исследования Samdani T. 2013 года у 40 % пациентов, проходящих скрининговую виртуальную колоноскопию, были выявлены проблемы за пределами кишечника. В 11 % случаев эти проблемы оказались клинически значимыми и 0,8 % пациентов потребовалось неотложное лечение.