Выход «Узника Азкабана» ознаменовал изменения в традициях серии: впервые юный волшебник не колдовал на Game Boy Color и PlayStation. Они окончательно устарели и уступили место новому поколению консолей. Таким образом, разрабатывалось всего три версии «Азкабана» для пяти актуальных на тот момент платформ: PlayStation 2, GameCube, Xbox, Game Boy Advance и ПК.
Но это не единственная измена традициям. «Будь Гарри Поттером!» – тот концепт, который направлял разработку всех предыдущих игр, творческий компас, от которого нельзя было отклоняться. Очевидно, «Тайная комната» тоже им руководствовалась, и неудивительно: это была первая игра EA UK, созданная за два года для нового поколения консолей, – с чего бы ей отступать от первоначального принципа? Поэтому версии для ПК, PlayStation и портативных консолей тоже не нуждались в обновлении формулы для этой игры.
Третий учебный год Гарри должен был эволюционировать, выйти за рамки привычного и предложить новые концепции. Хотя ни один разработчик прямо не озвучивает ключевую идею этой части, ее можно сформулировать так: «Будь Гарри, Роном и Гермионой!» Теперь идея заключалась в том, чтобы дать игроку поиграть за всех троих, переключаясь между ними в любой момент. Если не учитывать версию «Комнаты» для GBC, во всех предыдущих играх Рон и Гермиона были рядовыми NPC, которые выполняли роль гидов в Хогвартсе.
Отныне Рон и Гермиона получили целые уровни, посвященные им, уникальные способности и специфические заклинания в каждой версии. На домашних консолях и GBA они и вовсе постоянно помогают Гарри во время исследования замка и его подземелий.