Ранее уже говорилось о том, как трудно было восстановить Иерусалимский Храм и как лидеры Иудеи боролись за постройку хотя бы небольшого здания Храма. В течение последующих лет храмовый комплекс достраивался, так что к началу эллинистических реформ он был расширен и переделан, превратившись к тому же в хранилище денежных фондов как евреев Палестины, так и евреев диаспоры. Более того, само расположение Храма на холме, господствующем над городом, придавало ему большую стратегическую ценность. Весь холм — Храмовая Гора — был занят храмовыми постройками, хотя сама по себе гора была, без сомнения, несколько меньше той, какой она предстает взгляду сегодня, после строительных работ царя Ирода. Антиох III подтвердил еврейский закон, гласящий, что неевреи могли заходить лишь во внешнюю часть Храмовой Горы. Иноверцы, т.е. те, кто были ритуально нечисты, не допускались на территорию Храма.

Комплекс Храма представлял собой систему помещений, выполнявших различные функции. Помимо дворов женщин, израильтян, священников и собственно здания Храма, которое включало в себя Святая Святых, в него входили комнаты для переодевания, склады и помещения, выполнявшие другие функции. Для благословения священников и пения левитов, которые являлись частью каждодневного ритуала, существовал помост. Большой алтарь и специальные подготовительные отсеки делали возможным жертвоприношение животных в соответствии с законами Пятикнижия. Алтарь для воскурений и менора находились во дворе священников. Храм был богато украшен.

Служители Храма, как священники, так и левиты, были разделены на двадцать четыре группы, называемые стражами, каждая из которых служила в течение недели и которые сменяли друг друга на протяжении всего года. Каждая стража возглавлялась одним из ее членов и в свою очередь делилась на подгруппы. Священники занимались жертвоприношением животных, левиты помогали им и в частности занимались пением псалмов в момент совершения ритуала. Строгое следование законам Торы гарантировало чистоту и святость священников, бывших потомками Аарона, брата Моисея. Они носили особые одеяния, описанные в Пятикнижии, и определяли время служб посредством интерпретации соответствующих библейских отрывков. В большинстве случаев решения в области ритуального и священнического законов принимались на основании Торы и ее интерпретации.

Ежедневные службы проводились в соответствии с предписаниями Торы для утренних и дневных жертвоприношений. Библейские псалмы играли значительную роль в ритуале, однако трудно сказать, насколько употребительны были другие молитвы. Вероятнее всего, детально разработанная литургия стала частью храмовой службы в хасмонейский (маккавейский) период. Левиты сопровождали жертвоприношения игрой на различных музыкальных инструментах. Трубы и шофары звучали во время определенных ритуалов, как то предписывалось Пятикнижием. Специальные праздничные жертвы и приношения, принесение десятины и других даров, жертвоприношения добровольные и искупительные за грех также являлись частью храмового ритуала.

Тора предписывала выделение десятины священникам и левитам для обеспечения материальной поддержки служителей Храма. В ранние годы существования Второго Храма эти приношения собирались и распределялись администрацией Храма. На протяжении большей части этого периода первосвященник и его подчиненные занимались также сбором и распределением других средств, поступавших в качестве налогов. Тем не менее позднее практика централизованного сбора и распределения десятин и приношений была заменена их распределением на местах, что, вероятно, практиковалось уже во времена Первого Храма.

В III и IV вв. до н.э. Храм представлял собой нечто значительно большее, чем религиозный и культовый центр. Он был центром еврейского самоуправления в той степени, в которой еврейская община сохраняла свою автономию в рамках Птолемеевской и Селевкидской империи. Первосвященник и его помощники сосредоточили со временем в своих руках значительную светскую власть и большие финансовые средства и контролировали внутреннюю жизнь еврейского населения. Поэтому позднее, когда сторонники эллинизации добились первосвященства и попытались превратить Храм в эллинистический культовый центр, они бросили вызов не только религиозной традиции, но и самой природе еврейского народа. Когда неумолимые исторические события привели в конце I в. н.э. к разрушению Храма и прекращению жертвоприношений, в истории иудаизма была открыта новая страница.