В конце 1924 года в руководстве обновленцев происходят определенного рода изменения: на покой ушел митрополит Евдоким (Мещерский) – в связи со скандалом вокруг дела обновленческого епископа Николая (Соловья). Место его занял клирик еще синодального поставления митрополит Вениамин (Муратовский), человек более пассивный, преклонных лет, не принесший обновленцам дополнительной респектабельности.
В сентябре – октябре 1925 года обновленцы созвали свой второй лжесобор, который они назвали Третьим Поместным Собором Православной Церкви на территории СССР. Там собралась значительная часть обновленцев: 106 архиереев, более ста клириков и более ста мирян. Присутствовали, в основном, сторонники Синодальной Церкви; люди Красницкого в этом «соборе» не участвовали.
Новый «собор» по своему эффекту был уже несравним с первым обновленческим лжесобором. Он лишь подтвердил его решения, в частности, о законности низложения Патриарха Тихона и каноничности обновленческого ВЦУ, брачный епископат, второбрачие духовенства, новый календарный стиль; признал систему синодального управления и автокефалию Украинской обновленческой церкви. Власти уже не так активно поддерживали обновленцев, чувствуя, что они уже начинают сходить с исторической арены.
Вся дальнейшая история обновленчества – это история его постепенного исчезновения. Вскоре, в 30-е годы, обновленцам самим придется испить чашу репрессий со стороны властей.