Ученый в области травматологии и ортопедии, артрологии и биотрибологии. Академик (2003, чл. – корр. с 2000), доктор медицинских наук (1992), профессор (2001). Заслуженный врач Республики Беларусь (1998).

Родился в г. Мурманске (Россия). Окончил лечебный факультет Минского государственного медицинского института (1972), получив специальность врача-лечебника. В 1972–1973 гг. – врач-интерн по хирургии в 6-й городской клинической больнице г. Минска. В 1973–1975 гг. служил в должности врача в рядах Советской армии в г. Хмельницкий (Украина). С 1975 г. и до конца жизни работал в Белорусском НИИ травматологии и ортопедии Министерства здравоохранения БССР: младший научный сотрудник (1975–1980), старший научный сотрудник клинического отдела (1980–1989), руководитель лаборатории патологии и трибологии суставов (1989–1993), клинического отдела (1993), с 1993 г. – директор института.

С 1993 г. являлся главным внештатным ортопедом-травматологом Мин истерства здравоохранения Республики Беларусь. Проводил большую практическую и организационно-методическую работу по укреплению ортопедо-травматологической службы страны, широкому внедрению высокотехнологичных методов хирургического лечения, оснащению лечебного процесса современным диагностическим и хирургическим оборудованием, подготовке кадров, формированию государственных программ развития практического здравоохранения, профилактики травматизма и снижения его инвалидизирующих последствий. Был инициатором и организатором многочисленных конференций и рабочих совещаний по вопросам артроскопической хирургии, эндопротезирования, нейротравматологии.

Основные научные работы фундаментального и прикладного значения посвящены обоснованию и разработке новых методов диагностики и хирургического лечения (артроскопическая микрохирургия, эндопротезирование суставов, остеосинтез, реконструктивные операции) ревмаортопедических заболеваний, переломов и спортивной травмы суставов, исследованию механизмов и природы низкого трения суставных хрящей. Установил ранее неизвестное свойство синовиальной среды обеспечивать высокую антифрикционность хрящей в суставах в силу жидкокристаллического состояния синовиальной жидкости и присутствия в ней мезогенных соединений холестерина. Разработал новые лекарственные препараты – модификаторы свойств синовиальной жидкости, технологии получения жидкокристаллической биосубстанции для их изготовления, методы терапии суставной патологии с их применением, трибометрическое оборудование и способы изучения натуральных и искусственных смазочных сред, антифрикционные полимерные материалы для медицины.

Внедрил в Республике Беларусь артроскопическую хирургию крупных суставов и эндопротезирование коленного сустава, содействовал широкому применению в клинической практике методов эндопротезирования тазобедренного сустава при ревмаортопедических заболеваниях и травматических повреждениях. Практическим итогом работы Е. Д. Белоенко стало создание первого ревма-ортопедического отделения, а затем Республиканского центра патологии суставов и спортивной травмы на базе Белорусского НИИ травматологии и ортопедии.

Разработанные Е. Д. Белоенко лечебно-диагностические технологии, применяемые при ревмаортопедических заболеваниях и травмах суставов, отличаются глубоким экспериментальным обоснованием и длительными наблюдениями клинических результатов. Они использовались при создании методических документов, инструкций и приказов Министерства здравоохранения Республики Беларусь, регламентирующих работу ортопедо-травматологической службы, в том числе при оказании помощи больным с патологией суставов и белорусским спортсменам при подготовке к Олимпийским играм. Разработки защищены пакетом охранных документов.

Являлся членом международного общества хирургов травматологов-ортопедов (SICOT) с 1997 г., членом президиума белорусских обществ травматологов-ортопедов, биофизиков и фотобиологов. Избран академиком Белорусской инженерной академии (1996).

Награжден серебряной медалью им П. Л. Капицы «Автору научного открытия».