Ученый-экономист. Доктор экономических наук (1981), профессор (1987).

Родился в д. Гейдино Александровского р-на Донецкой обл. (Украина). Участник Великой Отечественной войны (1941–1945). После окончания с отличием Харьковского автодорожного института (1951) был направлен в Белорусскую ССР. Работал в Минской обл.: в Дзержинском р-не возглавлял Путчинскую (1952–1955) и Фанипольскую (1956–1958) машинно-тракторные станции, был председателем Плегденицкого райисполкома (с 1958), первым секретарем Старобинского райкома КПБ (с 1959), начальником Слуцкого территориального колхозно-совхозного управления (с 1962). В 1965 г. назначен начальником Главного управления механизации и электрификации Министерства сельского хозяйства БССР, с 1965 г. – секретарь Минского обкома КПБ. В 1975–1985 гг. – директор Белорусского НИИ экономики и организации сельского хозяйства. В 1985–2004 гг. – в Институте аграрной экономики НАН Беларуси: заведующий отделом, советник директора.

Изучал проблемы научно-технического прогресса, специализации и рентабельности предприятий АПК, управления качеством сельскохозяйственной продукции в рыночных условиях. Много внимания уделял проблеме эффективности сельскохозяйственного производства. Особую роль сыграл в разработке проблемы качества труда и продукции как в масштабах республик бывшего СССР, так и стран, входивших в Совет экономической взаимопомощи. Проблема качества стала ведущей в научно-исследовательской деятельности Н. Ф. Прокопенко. Он создал теорию качества труда, теорию формирования, управления и реализации качества продукции. Был руководителем союзной программы «Качество в АПК». Под его руководством над разработкой проблемы качества работало свыше 50 научно-исследовательских институтов и других научных организаций СССР, были созданы «Комплексные системы управления качеством труда и продукции в сельскохозяйственном предприятии», разработана методика отраслевой стандартизации организационно-экономических решений и типовых технологических операций.

Н. Ф. Прокопенко являлся членом Европейской ассоциации экономистов от СССР, заместителем председателя координационного Совета Министерства сельского хозяйства СССР по разработке проблем качества, председателем секции НТС Госстандарта СССР, членом комиссии Президиума ВАСХНИЛ по Продовольственной программе.

Награжден орденами Красной Звезды (1944), Ленина (1966), Трудового Красного Знамени (1971), Октябрьской Революции (1973), Отечественной войны I степени (1985), медалями.