Война была вызвана дипломатическими и пограничными спорами между Швецией и Россией, а кроме того, Швеция была обеспокоена появлением Северного морского пути через Архангельск. Шведы потерпели ряд военных поражений в 1555–1556 годах, что заставило их вернуться к прежней системе отношений и признать существующие границы[33].

Нападение на новгородские рубежи шведской армии при поддержке флота в 1555 году было оперативно отражено русскими войсками. После чего последовал карательный поход крупных сил русской армии в Финляндию, что вынудило шведов возобновить перемирие[34].

В 1537 году между Швецией и Россией продлено перемирие на условиях Ореховского договора 1323 года на 60 лет. Однако на практике шведы отказывались соблюдать невыгодные им границы, и в 1554 году последовал ряд нападений на приграничные русские земли, в том числе на Печерский монастырь. К порубежному конфликту прибавился дипломатический: шведский король Густав Ваза посчитал унизительным посольский обычай вести со шведами и ливонцами переговоры от имени наместников Великого Новгорода, а не от имени самого русского государя. Наконец, шведы увидели опасность в налаживании морской торговли России с Англией через Холмогоры (с 1554 года). Вместе с тем попытки создания широкой антироссийской коалиции в составе Швеции, Дании, Ливонии и Литвы не увенчались успехом, и шведы начали войну в одиночку, в расчете на занятость русской армии в южных конфликтах (с Крымским и Астраханским ханствами)[35].

Посланник новгородского наместника был задержан в Стокгольме, ограблены и арестованы русские купцы. В январе 1555 года отряд Я. Бибикова, посланный из Новгорода на рубеж для переговоров со шведскими представителями, был разгромлен шведами. Весной они стали собирать войска в Выборге и Або, при известии о чем на рубеж отправилось войско князя А. И. Ногтева-Суздальского. В конце августа 1555 года попытка шведов при помощи флотилии адмирала Багге взять Орешек была сорвана активными действиями русских войск, и после трех недель осады шведам пришлось отступить с потерями. В начале 1556 года крупная русская армия князя П. М. Щенятева, включавшая татарские отряды, совершила поход на Выборг, причем был сожжен город Кивинебб, разгромлены шведские войска на подступах к Выборгу и отряд шведов, спешивший на деблокаду города. Это заставило шведов в июне 1556 года просить о мире. После полного подчинения окрестностей и долины реки Вуоксы русские войска с большим «полоном» вернулись домой[36].

Несмотря на все попытки шведов изменить традицию, 21 марта 1557 года между наместником новгородским и королем Швеции было формально заключено Второе новгородское перемирие. По его условиям Швеция продлевала перемирие на 40 лет и признавала условия Ореховского договора 1323 года. Кроме того, утверждалась свобода торговли между Россией и Швецией и свободный пропуск гонцов из Русского государства во все страны. Швеция стала одним из основных соперников Русского государства в Балтийском регионе.