После дня победы американские власти арестовали Ильзу по обвинению в преступлениях против человечности.

Уже в тюрьме тихая и скромная фрау Кох родила ребенка от кого-то из военных (то ли немцев, то ли американцев – это тайна, покрытая мраком). Спустя пару лет Ильзу все же выпустили, так как сочли ее преступления недостаточно доказанными, но вскоре под давлением общественности женщину вновь арестовали и предали публичному суду. На процессе выступали не только выжившие узники Бухенвальда, но и коллеги женщины. Против 200 свидетелей обвинения выступило 50 свидетелей защиты. Конечно, Ильза была повинна в преступлениях против человечества, но не более чем все другие сотрудники лагерей, не более жен военных, завидовавших ее перчаткам.

Ильза стала символом жестокости, на которую решили спустить всех собак. Ее приговорили к пожизненному тюремному заключению. В 1960-х она все же покончила с собой, так и не признав своей вины. В письмах к сыну она говорила о том, что просто стала козлом отпущения, на которого решили свалить все чужие преступления. Конечно, она проявляла жестокость, но ведь именно в этом и заключалась ее работа.