29 мая 1453 года орды турок-мусульман захватили Константинополь и уничтожили Восточную Римскую империю (Византию). Так Бог наказал тех, кто пытался спасти свою страну ценой веры. Византия в 1441 году приняла Флорентийскую унию с Римом, отрекшись от Православия. Лишь святитель Марк Эфесский отстаивал верность апостольскому Преданию. Сразу после падения Константинополя Церковь отказалась от ереси, но состояние ее было крайне тяжелым. Большая часть православных оказалась под властью турок, воспринимавших христиан как скот (райя), лишенный почти всех прав. Были разрушены все школы, патриархи сменялись по желанию султана, все более или менее талантливые люди истреблялись или бежали на Запад. Христиане должны были платить огромные налоги и отдавать своих детей в янычары, где тех насильно делали мусульманами.

Но и в это время Церковь продолжала свою спасительную миссию. Множество мучеников просияло в Турецкой империи во время многовековых гонений. Воспользовавшись слабостью Православия, западные еретики (и римо-католики, и протестанты) пытались при помощи обмана и подкупа совратить христиан. Но Церковь противостояла этому на Соборах XV–XVII веков. Были осуждены как заблуждения католичества (в 1484 году), так и протестантские измышления (Соборы 1640, 1642, 1672 годов).

В XVIII веке начинается великое возрождение Православия. Святой Косма Этолийский ходил по городам и деревням Греции и Албании и обращал многих ко Христу. Он творил множество чудес и пророчествовал. Его подвиг вызвал ненависть иудеев и мусульман, и святой Косма удостоился мученического венца. Одновременно на Святой Горе Афон началось возрождение монашества. Преподобный Никодим Святогорец вместе со своими друзьями восстановил практику частого причащения Святых Таин и составил сборник святоотеческих творений «Добротолюбие», по которому православные и доныне учатся восхождению на Небеса. Этот труд привел к тому, что православные стали подниматься с колен, и в XIX веке при помощи России ряд стран сбросили с себя турецкое иго.