Женский монастырь был основан около 908 г. в Константинополе трудами друнгария Константина Липса. Вскоре после того была освящена в присутствии самого Льва Мудрого небольшая соборная церковь размерами 13 на 9,5 м, с многогранной средней апсидой и двумя ярусами окон – тройных внизу и щелевидных выше. В целом первоначальная архитектура храма весьма близка кафоликону Мирелейона. До разграбления крестоносцами в 1204 г. в соборе хранились реликвии – оставшиеся в камне столпы апостола Павла и оправленная в золото глава апостола Филиппа.

Палеологи пристроили к монастырю церковь Иоанна Предтечи. Она была заложена с южной стороны монастыря Липса в Константинополе императрицей Феодорой – вдовой восстановителя империи Михаила VIII.

Монастырь Липса

В храме, прежде богато украшенном фресками и мозаиками, была погребена не только сама императрица, но и ее сыновья – Константин и Андроник II, а также супруга последнего. Одно из последних захоронений принадлежит московской великой княжне Анне Васильевне, жене императора Иоанна VII. В течение XIV в. церковь была расширена за счет пристройки придела, паперти и больницы.

При султане Баязиде II (вероятно, в 1496 г.) оба храма были объединены в мечеть Фенари Иса. Здания горели в 1633 и 1918 гг. и были реставрированы в 1980 х.