1) XMind 8 (официальный сайт программы: http://www.xmind.net/) является несомненным лидером среди бесплатных десктопных программ для создания интеллект-карт. Графические возможности XMind немного беднее, чем у платных программ, вроде MindManager или MINDMAP, но по функционалу, надежности и скорости работы она им нисколько не уступает.

Фрагмент конспекта в формате интеллект-карты, созданной в программе XMind
Программа доступна для Windows, Linux и Mac. Кроме вполне функциональной обычной версии программы, также существуют и платные её варианты с расширенным функционалом: XMind 8 Plus (стоимость лицензии на одного пользователя около 80 USD) и XMind 8 Pro (стоимость около 100 USD). В платных версиях добавляются некоторые графические возможности (настройка тем, клипарты, шаблоны некоторых бизнес-диаграмм и др.), а также дополнительные форматы файлов для импорта-экспорта (например, импортировать карту в формате MindManager — *.mmap — можно в любой версии XMind, а вот экспортировать — только в XMind Pro).
На мой взгляд интерфейс (полностью русифицированный) программы не очень удобный, и очень уж скромный, без всяких дизайнерских изысков. XMind очень удобна для создания интеллект-карт по книгам, но при создании больших карт может подтормаживать. Добавлю, что из всех известных мне программ для создания интеллект-карт только XMind безукоризненно справляется с экспортом больших карт в файлы формата *.pdf или в изображения (*.png, *.jpg) с высоким разрешением.
2) Наиболее интересным решением из всех бесплатных программ для построения интеллект-карт является FreeMind 1.1.0 (Beta 2; официальный сайт: http://freemind.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page).

Внешний вид интеллект-карты, созданной в программе FreeMind
Программа написана на Java, и подойдёт для любой операционной системы (Windows, Linux, Mac), если только у вас установлены исполняемые файлы Java (Java Runtime Environment).
С этой программой у меня связана одна жуткая история. Я пользовался ей года два подряд и был в целом доволен её возможностями. Но после очередного апгрейда моего домашнего компьютера, я вдруг столкнулся с пренеприятнейшей вещью — при попытке запустить FreeMind система (Windows) зависала, демонстрируя «синий экран смерти». Когда такое произошло раза три подряд, я вбил в поисковик код системного сбоя, после чего получил ответ, что синий экран вызван неустранимым конфликтом между драйвером моей видеокарты (обновленной при апгрейде) и Java. Попытки по очереди переустановить все актуальные на данный момент драйвера к видеокарте к положительному результату не привели. После чего выбор между хорошей видеокартой и несчастной FreeMind был сделан в пользу видеокарты (а из бесплатных программ я тогда окончательно перешёл на XMind). Понимаю, что этот случай скорее исключение, но на всякий случай рассказываю. Всё-таки бесплатные программы обладают меньшей устойчивостью и надежностью в работе.
Чем интересна программа FreeMind? Её базовые возможности для построения интеллект-карт мало чем отличаются от функционала большинства других подобных программ. Мало того, графические возможности программы крайне ограничены, а «олдскульный» (в дизайне начала 2000-х) интерфейс программы многим покажется убогим и неудобным. Например, если вы захотите добавить в интеллект-карту внешнее изображение, то задавать размеры этой картинки придётся вручную, прописывая код в отдельном окне html-редактора. Такая задача будет несложной для компьютерного гика, но простому пользователю такие «танцы с бубном» не доставят удовольствия. Тем не менее, если не гнаться за красивой графикой, для простого конспектирования книг программа прекрасно подходит.
Возможности FreeMind в полной мере раскрываются, если вы владеете хотя бы азами программирования и хотите создать целостную систему работы с информацией (а не просто конспектировать в виде интеллект-карт отдельные книги). Например, можно интегрировать интеллект-карты FreeMind в различные вики-проекты; можно добавлять к элементам карты (узлам) неограниченное количество атрибутов, фактически превращая карту в базу данных или в график проекта; можно добавлять математические формулы и др.
Если вы работаете с книгами «для пользы дела» в рамках написания научной работы, то советую обратить пристальное внимание на программу Docear (http://www.docear.org/; о Docear я писал подробно в концевой сноске № 56, когда в главе о конспектировании упоминал «менеджеры цитат»). Это версия FreeMind, которая обладает несколькими уникальными функциями. Например, она позволяет создавать интеллект-карту из документов в формате *.pdf в «полуавтоматическом» режиме. При чтении документа достаточно выделить интересную фразу/цитату, и она тут же становится частью интеллект-карты. Кроме того, Docear специализируется на корректной обработке библиографической информации (оформлении цитат, указании изданий и т. п.), что крайне важно при написании научных текстов. Все созданные вами интеллект-карты, и вошедшие в них выписки/цитаты из прочитанных книг Docear хранит в единой базе данных, то есть по сути создаёт вашу персональную научную картотеку.
3) Cayra 0.9.5. Пишу об этой бесплатной программе из ностальгических соображений — это самая-самая первая программа, которую я стал использовать для рисования интеллект-карт на ПК. Программа работает под Windows, создана в 2007 году, но сейчас, увы, это уже мертвый проект. Тем не менее программка исправно работает (скачать можно здесь: https://www.mind-mapping.org/blog/2012/07/news-about-cayra/)!
Cayra является минималистичной (во всех смыслах) программой для создания интеллект-карт: после установки её размер всего около 6 Мб; у неё очень простой и удобный интерфейс; не поддерживает импорт-экспорт интеллект-карт в других форматах (можно экспортировать карту только в *.jpg или *html); в ней отсутствуют какие-либо графические «навороты» (вроде предустановленных тем или редактора стилей) и шаблоны бизнес-процессов.

Создание интеллект-карты с помощью программы Cayra
Мне лично Cayra понравилась графикой: во-первых, она больше всего напоминает рисование интеллект-карты от руки; а во-вторых, графика является «резиновой» (адаптивной), что очень удобно при создании и просмотре карты. Функциональных возможностей программы вполне достаточно, чтобы сделать интеллект-карту по книге, однако она не очень удобна для конспектирования и работы с большими по объёму текстами.