Петр II Негош умер рано, в возрасте 37 лет, в самом расцвете своего таланта. Уже в 20-летнем возрасте у него возникли первые признаки туберкулеза, с которым он боролся до конца жизни. Он умер 19 октября 1851 года, в тот же самый день, что и 21 год назад стал правителем Черногории. Все свои наличные средства в сумме 50 тыс. рублей, хранящиеся в банке в Петербурге, владыка завещал «своему несчастному, но геройскому народу».

Петр II Петрович Негош был похоронен на горе Ловчен, о чем просил в своем завещании. В 1947 году на его могиле сооружен мавзолей, который построил знаменитый югославский архитектор Иван Мештрович. Преемником Петра II Петровича Негоша стал его племянник – Данило Петрович Негош.