В случае присутствия в предложении глагола to be в Present Simple Tense (настоящем простом времени) и Past Simple Tense (прошедшем простом времени) схема построения отрицательного предложения изменяется.

Отрицательная частица not встает после глагола to be в Present Simple Tense (настоящем простом времени) и Past Simple Tense (прошедшем простом времени). Таким образом, подобные отрицательные предложения формируются по схеме:

П + глагол to be +not + все остальные члены предложения, если таковые есть в предложении.

Где П – подлежащее.

Примеры (подлежащее подчёркнуто одной чертой):

Ручка не на столе. —The pens are not (не находятся) on the table.

Книги не на месте. —The books are not (не находятся) in the place.

Мы не в классе. —We in are not (не находимся) the classroom.

Ручка не была на столе. —The pen was not (не была) on the table.

В остальных временах английского языка схема отрицательного предложения и с глаголом to be, также, будет неизменна: П+ С1 not +С2. Например:

Книги не будут на месте. —The books will not be (не будут) in the place.

*Примечание: глагол to be в третьей форме (V3) имеет форму been, данная форма участвует во временах группы Perfrect.