Начал свои закулисные игры и Магнус. Поняв, что тесть Иван Грозный теряет интерес к продолжению борьбы за Ливонию, не получив обещанные бочки с золотом, Ригу и Ревель, Магнус начинает тайные переговоры с новым лидером Речи Посполитой – Стефаном Баторием. Через своего духовника теолога Христиана Шрапфера он обратился к герцогу Готхарту Кетлеру с просьбой об установлении канала связи со Стефаном Баторием.
В самый разгар тайных переговоров Иван IV неожиданно вызывает Магнуса во Псков. Там он намекает, что знает о факте переписки с Кетлером. (Московская контрразведка уже тогда работала исправно.) Затем даёт поручение голдовнику срочно начать военные действия в Лифляндии, территории и многие города которой находились под присягой Речи Посполитой.
Магнус начал исполнять волю царя.
Неожиданно из города Вендена он пишет послание всем ещё непокорённым городам. Но его содержание приводит в неистовство Ивана IV. «Принимает он, де, в качестве короля Ливонии и немецкого христианского государя под свое покровительство и управление все остальные города и земли и уверяет, что обыватели их, подчинившись ему, нисколько не будут действовать несогласно со своими обязанностями к Польше, ибо их покорность послужит только на пользу польской короне».
Этими словами Магнус провозглашал себя чуть ли не польским наместником. Узнав о таком демарше, Иван Грозный потребовал привезти Магнуса ко двору. К моменту встречи московский царь уже располагал информацией о тайных переговорах с Баторием. Он приказал поставить Магнуса перед собой на колени и закричал: «Ты, презренный глупец, хотел покорить Ливонию, сделаться её королем! Тебя, бежавшего из своего отечества, скитавшегося в наготе и бедности, принял я в своё семейство и дал тебе, недостойному, в жёны дочь моего брата, обогатил тебя, дал подданных, денег, одежду, возвысил тебя, а ты своему благодетелю изменил…»
После этих слов по команде царя стрелец схватил Магнуса за шиворот и поволок в старую крестьянскую избу, в которой всю ночь его продержали почти голым.
Магнус ждал казни. Все знали, что измену царь не прощает. Но Грозный поступил более тонко: он просто отправил Магнуса в одну из ливонских крепостей, из которой голштинец вместе с женой Марией предсказуемо убежал на Запад, под покровительство Стефана Батория.
Желая выслужиться перед новым хозяином, предатель Магнус даже успел поучаствовать в походе Батория на Москву. Но после подписания мира с русским царём Баторий ничем не наградил Магнуса. На следующий год, в 1583 году, герцог-предатель, всеми покинутый, умер в своём замке.