Был президентом Конго с 1963 по 1968 год и пытался проводить социалистический курс в политике и экономике страны. На второй год своего правления он объявил Конго однопартийным государством и начал национализацию. В политике его администрация ориентировалась на Китай, СССР и Кубу. Массамба-Деба встретился с Че Геварой и прервал дипломатические отношения с США. В Браззавиле базировался кубинский военный контингент.

Поначалу Массамба-Деба был очень популярен в стране, к тому же в Конго вовсю строились заводы, фабрики, школы, институты и больницы. Однако авторитарность президента привела к появлению оппозиции, которую возглавил командир десантников Мариан Нгуаби. В 1968 году Нгуаби был арестован, что вызвало военный мятеж. Нгуаби пришлось освободить, а Массамба-Деба сбежал, сложив с себя полномочия. Мариан Нгуаби занял президентское кресло – но оказался ещё более жёстким и радикальным политиком.

В 1977 году его убили заговорщики, а в руководстве заговором был обвинён бывший глава государства Массамба-Деба. Его быстро осудили военным трибуналом и расстреляли. Его вина никогда не была доказана и, скорее всего, его подставили реальные организаторы убийства.