Отец Хармса Иван Павлович Ювачёв в молодости организовал тайный революционный кружок. За это он был сослан на остров Сахалин. После возвращения из ссылки он служил в Управлении сберегательных касс, а в свободное время писал книги – воспоминания о пережитом и размышления на религиозные темы. Он был членом общества, улучшающего положение заключённых. Там он встретил свою будущую жену Надежду Ивановну Колюбакину. Она заведовала убежищем для освободившихся из тюрьмы женщин – местом, где они могли жить, пока не находили себе работу и жильё. Там, в убежище, была её служебная квартира. В ней и родились трое детей Ювачёвых – Даниил 30 декабря 1905 года и две его младшие сестры.
По долгу службы отец часто находился в разъездах, но постоянно в письмах поддерживал связь с женой и наставлял её в воспитании детей. Он писал: «Чем проще и суровее – тем лучше».