4 марта 1917 года Временное правительство приняло решение ликвидировать Отдельный корпус жандармов (ОКЖ), включая и железнодорожную полицию, и Охранные отделения. Офицеров и нижних чинов ОКЖ предписывалось направлять в строевые части. В результате своих постов лишились до 90 % начальников КРО и их помощников и большинство младших агентов (занимались наружным наблюдением). Фактически почти все кадровые военных контрразведчиков оказались не у дел, а многие из них были арестованы. К осени 1917 года продолжали действовать подразделения ГУ ГШ и Московского военного округа. При этом эффективность уцелевших органов была крайне низка, т. к. в пылу «демократического» угара новые власти сделали все, чтобы раскрыть агентурный аппарат Департамента полиции, который использовался при политическом сыске. В результате имена большинства агентов попали на станицы газет, а те, кто избежал публичной огласки, предпочли прекратить сотрудничество с правоохранительными органами.

При этом Временное правительство, надо отдать ему должное, понимало необходимость существования военной контрразведки. Поэтому 23 апреля 1917 года генерал Новицкий утвердил «Временное положение о контрразведывательной службе во внутренних районах». 2 мая 1917 года Верховный главнокомандующий генерал М. В. Алексеев утвердил «Временное положение о контрразведке на театре военных действий».

В соответствии с «Положением» для тыловых районов система органов военной контрразведки была следующей. В ГУ ГШ вводилась должность обер-квартирмейстера, который отвечал за разведку и контрразведку. Один из его помощников занимал пост начальника вновь образованного КРУ (контрразведывательного управления), которое состояло, в свою очередь, из центрального КРО и центрального регистрационного бюро.

Начальник КРУ не только руководил работой КРО тыловых военных округов, но и организовывал работу по наиболее важным шпионским делам, возникающим как в Петрограде, так и в окружных КРО.

Центральный КРО занимался:

— внешней контрразведкой;

— разработкой иностранных дипломатических миссий;

— контрразведывательным обеспечением центральных военных и государственных учреждений.

Штат центрального КРО составлял 76 сотрудников (из них 10 наблюдательных агентов и 10 наружного наблюдения).

Центральное регистрационное бюро решало следующие задачи:

— организация архива;

— информационно-аналитическая работа;

— проведение различных экспертиз.

Также в его структуре функционировала фотолаборатория.

Для театра военных действий в структуре штаба Верховного главнокомандующего было создано КРУ, в состав которого вошло центральное КРО. Так же были созданы КРО фронтов, армий и КРО военных округов на театре военных действий. А 25 августа 1917 года были введены контрразведывательные пункты корпусов. Их начальники одновременно были помощниками руководителей КРО штабов армий.

Сама по себе система работоспособная и логичная. Правда, ее эффективность заметно снизилась из-за кадровых проблем. На посты начальников КРО и их помощников можно было назначать только офицеров Генштаба или лиц с высшим юридическим образованием. Понятно, что те и другие не имели опыта оперативно-розыскной работы. К тому же первые не имели квалифицированной юридической подготовки, а вторые — военной. Это проблему решили относительно просто. Все кандидаты должны окончить специальные подготовительные курсы. Сохранился запрет на прием в органы военной контрразведки офицеров ОКЖ и сотрудников Департамента полиции. К концу августа 1917 года Временному правительствуй все же удалось укомплектовать органы военной контрразведки.

Если деятельность системы военной контрразведки на территории Российской империи была частично восстановлена лишь к концу августа 1917 года, то в самом Петрограде все происходило по-другому. В столице действовало КРО штаба Петроградского военного округа под руководством Б. В. Никитина. Штатная численность сотрудников этого органа — 140 человек. Для сравнения — КРО штаба фронта в мае 1917 года насчитывало 48 человек. Справедливости ради отметим, Б. В. Никитин сосредоточил основные усилия своего учреждения на борьбе с большевиками, т. к. справедливо расценивал деятельность последних как эффективный способ подрыва боеспособности Российской армии. Также он установил связь со спецслужбами Антанты для разработки большевиков. Из шести делопроизводств КРО два (1-е и 3-е) занимались исключительно политическими делами[107].

Хотя военной контрразведкой занимались не только представители Вооруженных сил Российской империи, но и гражданские ведомства. Так, в июле 1917 года начал действовать Отдел контрразведки (ОКР) Министерства юстиции. Основными функциями этого органа были борьба со шпионажем воюющих с Россией держав и с насильственными попытками восстановления старого строя. Фактически этот орган должен был заниматься вопросами политического сыска, в т. ч. и в российских Вооруженных силах.

Летом 1917 года сотрудники ОКР Министерства юстиции разрабатывали материалы о заговоре в Ставке Верховного главнокомандующего и Генштабе, приверженце военной диктатуры личном ординарце генерала Л. Г. Корнилова кадете В. С. Завойко, создании монархических офицерских групп.

21 сентября 1917 года ОКР Министерства юстиции было расформировано.