После окончания Русско-японской войны были предприняты меры по коренному улучшению организации контрразведывательной службы. Это было связано с тем, что в районе боевых действий российская контрразведка бездействовала. И одной из причин бездействия российских спецслужб на сопках Манчжурии стало отсутствие профессиональных контрразведчиков.
Поэтому и было усилено взаимодействие офицеров Генерального штаба с охранным отделением. Последнее выделяло в распоряжение Генерального штаба своих опытных агентов.
В 1908 году, во время киевского съезда старших адъютантов разведывательных отделений, была выработана общая система организации военной контрразведки в мирное время.
Согласно этой системе контрразведкой должны были заниматься чины отдельного корпуса жандармерии, пограничной стражи под руководством старших адъютантов разведывательных отделений штабов военных округов.
Их деятельность контролировало 5-е делопроизводство Главного управления Генерального штаба. Был установлен тайный контроль за всеми иностранными гражданами, проживающими на территории военных округов[30].
Начиная с 1908 года правительство создает несколько межведомственных комиссий. Главный вопрос для обсуждения: создавать систему контрразведки при МВД или Военном ведомстве [31]?
В 1909 была собрана очередная специальная межведомственная комиссия под председательством директора Департамента полиции. На заседании комиссии было решено привлечь к делу контрразведки особых жандармских офицеров.
Комиссия так и не решила вопросы о взаимодействие жандармерии и штабов военных округов, о применении к иностранцам особых правил специального надзора, о подсудности дел по шпионажу специальному суду и т. п.
МВД и Министерству финансов (которому подчинялись пограничная и таможенная стража) вменялась неукоснительная борьба со шпионажем[32].
В 1910 году победила вторая точка зрения. И 8 июня 1911 года военный министр утвердил «Положение о контрразведывательных отделениях». Их системой руководил отдел генерала квартирмейстера Главного управления ГШ.
Центральный орган был представлен Петербургским отделением, ставшим преемником Разведочного отделения. Местные отделения создавались при штабах военных округов: Петербургское, Московское, Виленское, Варшавское, Киевское, Одесское, Тифлисское, Иркутское и Хабаровское контрразведывательные отделения (КРО)[33].
В июне 1911 года в составе Особого делопроизводства Отдела генерал-квартирмейстера Главного управления Генштаба создается Регистрационное отделение. Тогда же военный министр генерал от кавалерии В. А. Сухомлинов утвердил «Положение о контрразведывательных отделениях», «Инструкцию начальникам контрразведывательных отделений», «Правила регистрации лиц контрразведывательными отделениями» и «Инструкцию начальникам контрразведывательных отделений по расходованию ассигнованных им сумм и ведения отчетности по ним».
Для руководства созданными в крупных городах и военных округах контрразведывательными отделениями была учреждена должность помощника делопроизводителя Особого делопроизводства Отдела генерал-квартирмейстера ГУ ГШ, на которую был назначен подполковник Отдельного корпуса жандармов Владимир Михайлович Якубов.
Окружные КРО были сформированы при штабах Петербургского, Московского, Варшавского, Виленского, Киевского, Одесского, Тифлисского, Туркестанского, Иркутского и Приамурского военных округов.
Начальниками КРО назначались офицеры Отдельного корпуса жандармов; помощниками их могли быть как строевые армейские, так и жандармские офицеры.
Отличный от окружных КРО статус получило Петербургское городское КРО, заместившее собой прежнее Разведочное отделение, подчинённое напрямую Отделу генерал-квартирмейстера Главного управления Генерального штаба (Огенквар ГУ ГШ) и занимавшееся обеспечением безопасности центральных учреждений империи.
Кроме того, при Особом делопроизводстве Огенквара был создан нештатный центральный регистрационный орган во главе с В. М. Якубовым. В 1913 году он был присоединён к Петербургскому городскому КРО, что подтвердило статус последнего как головного органа контрразведки империи.
В апреле 1914 года Петербургское городское КРО переименовали в КРО ГУ ГШ. С 1911 года его возглавлял подполковник В. А. Ерандаков.
Расходы на содержания КРО[34] в год: