Русская эскадра покинула Константинополь 8 декабря 1920 года и пришла в Бизерту 22–23 декабря. С приходом в чужие воды, в совершенно новых условиях жизни и работы на кораблях, произошли прежде всего коренные изменения в штабе эскадры, подсказанные самой обстановкой: и. д. командующего Русской эскадрой был назначен контр-адмирал М.А. Беренс, начальником штаба – контр-адмирал А.И. Тихменев, старшим флаг-офицером – мичман А. Аесгафт271, офицером для связи с морским префектом – старший лейтенант Ю.В. Соловьев, флагманским инженером-механиком – генерал-майор В. Максименко и т. д.
Морской префект адмирал Варрней, идя навстречу просьбе контр-адмирала Машукова, предоставил Морскому корпусу на выбор один из находившихся в районе Бизерты лагерей или форт Джебель-Кебир. Комиссия под председательством капитана 1-го ранга Александрова остановила свой выбор на форте для размещения воспитанников и на находившемся в одном километре лагере Сфаят для персонала и складов. 13 января 1921 года воспитанники были переведены на берег. В результате в корпусе оказалось 17 офицеров-экстернов, около 235 гардемарин, ПО кадет, 60 офицеров и преподавателей, 40 человек команды и 50 человек семейств.
Семьи офицеров эскадры были помещены на приспособленном для общежития бывшем линейном корабле «Георгий Победоносец». Командиром корабля-общежития, стоявшего уже без одной трубы, мачт и флага у мола Бизертской гавани, был назначен контр-адмирал М. Подушкин272.
Казалось, жизнь в новых и необычайных условиях постепенно, но уверенно входила в колею… Все работали «не за страх, а за совесть», веря, надеясь и ожидая скорую возможность возвращения в родные воды. В 10 часов утра 30 октября 1924 года морской префект вице-адмирал Эксельманс прибыл на эскадренный миноносец «Дерзкий», где к этому времени были собраны все командиры и свободные от службы офицеры и корабельные гардемарины. Адмирал Эксельманс объявил о признании Францией СССР… и… С заходом солнца были спущены Андреевские флаги с тем, чтобы более не подниматься.
Одновременно с грустной церемонией спуска флагов на судах Русской эскадры была ограничена деятельность и Морского корпуса. Оставшиеся гардемарины и кадеты на форту Джебель-Кебир с 1921 года были переведены в лагерь Сфаят, но и здесь дни корпуса были уже сочтены. Сигнал «разойтись» прозвучал в Африке, в лагере Сфаят вблизи Бизерты 6 мая 1925 года. За время существования корпуса, открытого в Севастополе 17 октября 1919 года, через его учебную программу прошло 394 воспитанника, из которых получили аттестаты 300 человек. Итак, Бизертский Морской корпус – это последнее звено тех перипетий, которые испытала «Навигацкая школа», созданная Петром Великим 14 января 1701 года.
В храме-памятнике, воздвигнутом русскими белыми моряками в 1936 году в Бизерте, в 1950 году сооружена мраморная доска, на которой вырезаны имена всех кораблей, пришедших из Крыма в африканские воды на Рождество 1920 года. Флаг последнего командующего последней Русской эскадрой контр-адмирала М.А. Беренса хранится в музее О.О.Р.И.Ф. в Нью-Йорке.