После почти двух лет работы в Освенциме Менгеле перевели в другой концлагерь, откуда тот в 1945-м году и сбежал, притворившись простым солдатом.
Татуировки с группой крови у него не было, так что Менгеле удалось провернуть этот трюк. Некоторое время он жил в Баварии, а потом крысиными тропами (система отправки бывших нацистов в Латинскую Америку) улетел в Аргентину.
После того, как Моссад расправился с Эйхманом, Менгеле сбежал в Бразилию, где и благополучно скончался глубоким стариком. У него прихватило сердце, когда он купался в океане. До последних дней жизни он занимался околомедицинской деятельностью вроде продажи лекарств или подпольных абортов. По словам его сына, он не считал себя в чем-то виновным.