Мечеть Зайрек (Зайрек джами) представляет собой второй по величине после собора Святой Софии памятник византийского зодчества, сохранившийся от Константинополя.

Начиная с 1118 г. императрица Ирина строила на этом месте монастырский комплекс (церковь, библиотека, больница) в честь Христа Пантократора. После ее смерти в 1124 г. строительство продолжил император Иоанн II, который возвел чуть севернее церковь в честь иконы Богоматери Милостивой и соединил ее с монастырем крытым переходом с часовней Михаила Архангела. Оба венценосных ктитора были погребены в часовне, так же как и император Иоанн V из династии Палеологов.

С установлением Латинской империи монастырь Пантократора перешел в руки венецианского клира, который поместил в соборном храме знаменитую икону Одигитрии. Император Балдуин II устроил здесь свой дворец. После изгнания латинян из города в монастырь вернулась православная жизнь, а один из здешних монахов был избран патриархом под именем Геннадия Схолария сразу после взятия города турками. Он не смог предотвратить превращения монастыря в мечеть, которая получила название в память о Зайреке – мудреце из соседнего медресе.

К концу XX в. древние здания пришли в такой упадок, что ЮНЕСКО, чтобы спасти оставшееся, занесла их в список объектов Всемирного наследия, которым грозит уничтожение. После этого начались реставрационные работы на пожертвования частных лиц.