По справке из Московской Духовной Консистории, нынешняя церковь «построена 1788 года тщанием священников Максима Дионисиева и Иоанна Сергеева, приношениями прихожан и посторонних дателей». В 1750‑х годах Максим Дионисиев был диаконом Филипповской церкви. С 1760 годов в документах он значится уже священником означенной церкви. Отец Максим был весьма деятельным и уважаемым священником. Как раз в настоятельство о. Максима Филипповская церковь обветшала и потребовала срочной перестройки, о чем свидетельствует сохранившееся прошение его с приходскими людьми на имя митрополита Московского и Калужского Платона: «Генваря 20 дня 1777 года, поданным Вашему Высокопреосвященству от нас прошением представлено об означенной нашей приходской церкви убогих местах, а особливо в святом алтаре от самого почти фундамента, даже до свода оказались немалые расседины, кои время от времени умножаются, наводя крайнюю опасность. И что по учиненному со общаго нашего согласия архитектором Матвеем Федоровичем Казаковым осмотру, повреждение оной церкви оказалось от слабого фундамента, отчего по мнению ево, архитектора, необходимо следует настоящую церковь со старым алтарем, исключая трапезу и имеющийся при оной придел, всю до фундамента разобрать и вновь построить. И ныне по спешествующу Божию благоволению и Вашему архипастырскому благословению, собрано и приуготовлено, как материалов, так и наличных денег всего более пяти тысяч рублев. Того ради, Вашего Высокопреосвященства, милостивого архипастыря, покорнейше просим вышеозначенную нашу приходскую церковь разобрать и оную по нову возобновить».
Строительство по проекту М. Ф. Казакова и под руководством архитектора С. Карина длилось 10 лет, и к 1787 году был выстроен величественный храм в стиле раннего классицизма. Построенная церковь свт. Филиппа, митрополита Московского в Мещанской слободе, на месте старого одноименного храма XVII века, при трапезной 1752 года, была задумана в качестве домовой церкви подворья митрополита Платона, но проект подворья остался неосуществленным.

Придел прп. Алексия, Человека Божия