Сразу после разгрузки хранилища от овощей его очищают от растительных остатков, в течение лета проветривают до полного просушивания и заблаговременно, за 1,5–2 месяца до загрузки овощей, проводят влажную дезинфекцию с тем, чтобы хранилище успело просохнуть и в нем исчез запах препарата, применявшегося для дезинфекции. Для дезинфекции используют раствор хлорной извести, так же как это делают при дезинфекции конструкций парников и теплиц. После дезинфекции деревянные части хранилища обмазывают известковым молоком (1–2 кг извести на 10 л воды), в которое можно добавить медный купорос (500 г на 10 л известкового молока).